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PNAS:美科学家发现促进癌症的非编码RNA
文/admin      2015/12/14
  近日,国际著名学术期刊《美国国家科学院院刊》上在线发表西奈山伊坎医学院教授Benjamin Greenbaum的一篇研究文章,研究人员在癌细胞中发现了一组可以激发免疫反应的非编码RNA分子,它们具有与病原体相似的一些特征。由于这些分子在癌症中表达并扩增,它们造成的免疫反应有可能影响了癌症的生长。
 
  研究人员是通过探查基因组“暗物质”组成部分——称作为卫星DNA的区域来获得这一研究发现的。这一区域生成了大量有别于编码基因和mRNA的非编码rna 。这些神秘的RNA分子大多不生成蛋白质,但具有重要的调控功能。
 
  Benjamin Greenbaum博士说:“这些非编码RNA 存在于人类和小鼠癌细胞中。过去这些区域被称作为‘垃圾DNA’,在过去的5年里研究人员开始认识到这是许多功能重要非编码RNA 的居所。”Nina Bhardwaj博士补充说:“尽管仍然不清楚这些非编码RNA 的作用,癌症似乎利用了它们来激发免疫反应,促进了肿瘤生长及生存。”
 
  “如果进一步的研究确定这些分子帮助了癌症生成,或许有可能可以靶向和抑制这些分子,或利用它们作为标志物来探究癌症形成。另一方面,研究有可能表明了它们正在发动对癌症的某种免疫斗争。在这种情况下,我们可以尝试去推动这种努力。”
 
  该研究小组采用了一些来自理论物理学的数学工具来阐明非编码RNA 暗物质。Greenbaum博士说:“我们搜索了一个非编码RNA 大数据库来寻找不同寻常的核苷酸模式。将基因组的核苷酸序列视作为是单词。在人类基因组中,一些单词通常过表达及低表达。我们想知道在癌症中由卫星DNA区域转录的RNA这些模式有何不同。我们所采用的方法使得我们能够更快速地分析这个大数据集。”
 
  研究小组发现在几种癌症中,一些稀奇古怪的RNAs被激活及转录,这些不同寻常的RNAs大大地扩增——相比于在正常细胞中多了许多的拷贝。Bhardwaj博士说:“这些非编码RNA 有着与某些病原体相似的不同寻常的模式,这使得它们能够激发天然免疫反应。”
 
  Greenbaum博士说:“总之,我们相信这些非编码RNA 在介导抗癌免疫反应中发挥了重要的作用。要描述它们之间的明确互作仍有许多工作要做。”
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